"5 centímetros por segundo es la velocidad en la que caen las flores de cerezo". Esta es una historia acerca de la distancia entre dos personas, presentada en un formato de 3 capítulos; la historia se desarrolla en Japón a inicios de 1990, finalizando en un día más moderno. Después de su graduación en la escuela primaria, Takaki Tōno y su amiga Akari Shinohara tienen que separarse. Akari se muda a Tochigi debido al trabajo de sus padres mientras que Takaki iría a una escuela secundaria en Tokio. Los dos deciden mantenerse en contacto mediante cartas, pero a pesar de los sentimientos que existieron entre ellos, la única cosa que persistió era el tiempo.